微波消解儀常用的試劑主要包括以下幾種：
硝酸：強氧化劑，能氧化侵蝕金屬和有機物質，生成可溶性硝酸鹽，可溶解大多數硫化物。主要用于有機樣品（如脂肪、飲料、蛋白質、顏料、聚合物）及金屬氧化物、土壤等，常與雙氧水聯用增強消解效果。
硫酸：高效溶劑，可破壞幾乎所有有機化合物，通過脫水炭化加速消解，但沸點較高（超過多數微波消解罐限制溫度）。作為輔助酸，用于氫氧化物、金屬、礦石等樣品，需嚴格監控溫度。
（HF）：針對含硅樣品，將硅酸鹽轉化為四氟化硅（SiF?）氣體分離，與硝酸聯用可氧化鈦、鎢、鈮、鋯等難溶元素。適用于地質、陶瓷等含硅基質樣品的消解。
王水：由1體積硝酸與3體積鹽酸混合而成，通過生成亞硝酰氯（NOCl）增強氧化性，溶解能力強于單一酸。適用于無機物（如金和鉑）、植物組織、廢水的消解。
雙氧水（H?O?）：作為氧化劑與硝酸聯用，加速有機樣品分解，減少氮氧化物生成，常用于食品、生物樣品。
混合酸體系：根據樣品特性組合試劑，例如硝酸+用于地質樣品，硝酸+雙氧水用于有機物消解，可提升效率并減少試劑用量。
選擇試劑時需考慮樣品類型適配，例如有機樣品優先選擇硝酸-雙氧水體系，含硅樣品需添加，貴金屬樣品采用王水